扁平疣可以通过药物治疗、物理治疗、免疫治疗、化学剥脱治疗以及手术治疗等方法去除，具体需根据病情在医生指导下选择。扁平疣是人乳头瘤病毒感染引起的皮肤疾病，具有传染性，需尽早治疗避免扩散。
1、药物治疗
可在医生指导下局部外用维A酸乳膏、氟尿嘧啶软膏或咪喹莫特乳膏。维A酸乳膏通过调节表皮细胞分化抑制疣体增生；氟尿嘧啶软膏可干扰病毒DNA合成；咪喹莫特乳膏能激活免疫细胞清除病毒感染。
2、物理治疗
液氮冷冻治疗通过低温使疣体组织坏死脱落，适合数量较少的皮损。二氧化碳激光可直接气化疣体，治疗后需保持创面干燥，避免感染。
3、免疫治疗
对于顽固性或复发性扁平疣，可配合使用重组人干扰素α2b凝胶局部涂抹，或口服转移因子胶囊调节机体免疫应答，增强对病毒的清除能力。
4、化学剥脱治疗
使用水杨酸、三氯醋酸等化学制剂腐蚀疣体，需由专业人员在医疗机构操作，避免损伤周围正常皮肤。
5、手术治疗
对于个别较大的疣体，可在局部麻醉下采用刮匙刮除术，术后需定期换药防止继发感染。该方法可能遗留暂时性色素沉着，需谨慎选择。
日常需避免搔抓疣体，防止病毒自身接种扩散。保持皮肤清洁干燥，贴身衣物需单独清洗消毒。治疗期间若出现红肿、疼痛加剧或新发皮损，应及时复诊调整方案。所有治疗均需在皮肤科医生指导下进行，不可自行使用偏方或强行剥除疣体。