通常来说，奥硝唑和甲硝唑都是治疗牙疼的有效药物。它们都属于硝基咪唑类抗菌药，具有广谱抗菌作用，能够抑制厌氧菌的生长和繁殖。在治疗牙疼时，选择哪种药物需要根据患者的具体情况和医生的建议来决定。
奥硝唑和甲硝唑在抗菌谱、药效学和药代动力学等方面存在一定差异。奥硝唑对厌氧菌的抗菌活性更强，且在体内分布广泛，能够穿透组织屏障，对牙周组织感染的治疗效果较好。甲硝唑则对厌氧菌和部分需氧菌都有一定的抗菌作用，但对厌氧菌的抗菌活性相对较弱。此外，奥硝唑的副作用相对较小，对胃肠道的刺激较小，患者耐受性较好。
牙疼患者在治疗时，应遵医嘱用药，不可自行盲目用药。同时要注意口腔卫生，定期进行口腔检查，以预防牙疼的发生。如牙疼持续不缓解，应及时就医，以免延误病情。