通常，真菌孢子未见菌丝意味着在显微镜检查中观察到的样本中只发现了真菌的孢子，而没有发现菌丝。这种情况可能表明样本中的真菌处于生长的早期阶段，或者样本中的真菌数量较少，不足以形成明显的菌丝结构。
在真菌感染的诊断过程中，显微镜检查是一种常用的方法，通过观察样本中的真菌形态来确定是否存在感染。孢子是真菌繁殖的基本单位，而菌丝则是真菌生长和侵袭宿主组织的主要结构。如果只观察到孢子而未见菌丝，可能意味着感染尚处于初期，或者样本采集和处理过程中未能充分暴露菌丝。此外，不同的真菌种类在显微镜下的表现也有所不同，有些真菌可能更倾向于以孢子形式存在。
对于真菌感染的诊断和治疗，建议在医生的指导下进行。如果怀疑自己可能感染了真菌，应及时就医，并按照医嘱进行相应的检查和治疗。在用药方面，应在医生的指导下使用抗真菌药物，不可自行盲目用药，以免延误病情或产生不良反应。