事后避孕药通常对身体的伤害是有限的，但可能因人而异。由于其含有较高剂量的激素，可能会引起一些短期副作用，如恶心、头痛、乳房胀痛和月经不规律等。在医生指导下，正确使用事后避孕药，其对身体的伤害可以降到最低。
紧急避孕药物如左炔诺孕酮、米非司酮和醋酸乌利司他等，均应在医生指导下使用。这些药物通过干扰正常的排卵过程、改变宫颈黏液的粘稠度或影响子宫内膜，以达到避孕的效果。尽管它们可以减少意外怀孕的风险，但不应作为常规避孕方法，因为频繁使用可能会增加副作用的风险。
使用事后避孕药时，应遵循医嘱，注意个人的身体反应，并在必要时寻求医疗咨询。