巧克力囊肿患者一般可以怀孕，但可能会受到一定影响。巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种表现，可能导致盆腔粘连、输卵管阻塞等问题，从而影响受孕。此外，巧克力囊肿还可能引起炎症反应，影响卵巢功能，进一步降低受孕几率。
巧克力囊肿患者应在医生指导下使用药物治疗，如孕激素类药物（如黄体酮）、抗炎药物（如布洛芬）和激素类药物（如醋酸甲羟孕酮）等，以缓解症状、抑制囊肿生长。同时，患者还需定期复查，评估病情变化，必要时可考虑手术治疗。
对于巧克力囊肿患者，建议在医生指导下积极治疗，同时保持良好的生活习惯，以提高受孕几率。