肛门内部疼痛可能是便秘、肛裂或痔疮等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.便秘
由于饮食中纤维素摄入不足或水分摄入不够，导致大便干硬，排便困难，从而引起肛门内部疼痛。治疗便秘可以使用乳果糖口服溶液、聚乙二醇4000散和小麦纤维素颗粒等药物，应在医生指导下用药。
2.肛裂
排便时大便过硬或用力过猛，导致肛管皮肤撕裂，形成肛裂。治疗肛裂可以使用硝酸甘油软膏、复方角菜酸酯栓和双氯芬酸钠栓等药物，遵医嘱用药。
3.痔疮
长期便秘、久坐等不良生活习惯导致直肠静脉丛充血、扩张形成痔疮，引起肛门内部疼痛。治疗痔疮可以使用马应龙麝香痔疮膏、复方角菜酸酯栓和地奥司明片等药物，应在医生指导下用药。
除以上原因外，还可能与肛周脓肿、肛瘘等因素有关。平时应注意饮食调理，多吃蔬菜水果，保持大便通畅，避免久坐，定期到医院检查。