新生儿疑似败血症时，若腰穿失败可能对确诊存在一定影响，但医生通常会结合其他检查结果及临床表现综合判断。腰穿主要用于明确是否存在中枢神经系统感染，如脑膜炎，但并非诊断败血症的唯一依据。
当腰穿操作未能成功获取脑脊液时，临床医生会优先通过血液培养、C反应蛋白、降钙素原等实验室指标评估感染情况。同时，医生可能观察新生儿的症状，如体温不稳定、反应差、喂养困难等，结合血常规检查中的白细胞计数及中性粒细胞比例进行判断。若感染指标明显升高且伴随典型症状，即使未完成腰穿，也可能根据经验开始抗感染治疗。
对于疑似败血症的新生儿，即使首次腰穿失败，医生可能选择在病情允许时再次尝试操作，或在超声检查引导下提高穿刺成功率。若无法完成腰穿，部分情况下可能通过头部超声检查、MRI等影像学检查间接评估中枢神经系统状况。但需注意，这些检查无法完全替代脑脊液分析对脑膜炎的诊断价值。
家长需配合医生密切监测患儿生命体征及症状变化，如出现惊厥、前囟膨隆等神经系统表现，需及时告知医护人员。治疗方面，医生通常会根据临床经验选择覆盖常见病原菌的抗生素，待血液培养或复查结果明确后再调整用药。即使腰穿未成功，也不应延误抗感染治疗，以免病情进展。