穿刺活检存在一定的风险，但通常较为安全。该检查属于有创操作，可能因个体差异或操作因素引发并发症，但严重风险发生率较低。
出血是穿刺活检较常见的风险之一。若患者存在凝血功能异常或血管位置异常，穿刺过程中可能损伤血管导致局部出血。多数情况下出血量较小且可自行停止，极少数情况下可能需要进一步止血处理。感染风险与操作环境消毒情况及患者自身免疫力有关。规范的无菌操作下感染概率较低，但糖尿病或免疫功能低下者需格外注意。
气胸是肺部穿刺活检的潜在风险，多因穿刺针误伤胸膜或肺组织导致。发生率与病灶位置及操作者经验相关，少量气胸通常可自行吸收，严重时需胸腔闭式引流。部分患者术后可能出现短暂疼痛或不适，一般可通过休息或止痛药物缓解。罕见情况下可能发生邻近器官损伤，如肝脏活检导致胆汁漏等，但发生率极低。
进行穿刺活检前应完善凝血功能、影像学等检查，由医生评估适应症及禁忌症。术后需遵医嘱按压穿刺部位、保持敷料清洁，并密切观察有无剧烈疼痛、呼吸困难等异常症状。选择经验丰富的医疗机构进行操作可最大限度降低风险，患者无需过度焦虑，但需充分了解并签署知情同意书。