奥利司他胶囊的副作用通常属于轻度到中度，大多数患者可以耐受，但具体反应程度因人而异。该药常见胃肠道不良反应，部分患者可能出现肝功能异常等罕见情况，需在医生指导下使用。
奥利司他胶囊的主要副作用多与胃肠道相关。其通过抑制脂肪酶活性减少脂肪吸收，未被吸收的脂肪可能直接排出体外，导致油性斑点、脂肪泻、大便失禁等。这些症状在使用初期较为常见，通常随着身体适应或调整饮食结构后减轻。部分患者可能出现腹痛、腹胀、肛门不适等症状，可通过减少脂肪摄入缓解。
少数患者可能出现过敏反应，例如皮疹、瘙痒、荨麻疹等，严重时可能伴随血管神经性水肿。此外，奥利司他可能影响脂溶性维生素吸收，长期服用需注意补充维生素D、E、K等。极个别案例报告过严重肝损伤，但发生率极低，且多数停药后可逆。
使用奥利司他胶囊期间建议保持低脂饮食，避免加重胃肠道负担。若出现持续性腹痛、黄疸、尿色加深等肝功能异常表现，或严重过敏反应，应立即停药并就医。该药物需在医生评估肥胖程度及相关风险后规范使用，治疗期间建议定期监测肝功能指标。