辰砂的药用价值主要与其安神、镇惊、解毒等功效相关，在中医临床中常用于治疗心悸失眠、惊风癫痫及疮疡肿毒等病症。但因其含汞成分，现代临床应用需严格遵循规范。
1、安神定悸
辰砂性寒质重，中医认为其能清心火、镇心神，适用于心火亢盛引起的心神不宁、心悸失眠等症状。常与黄连、地黄等配伍，用于缓解焦虑、烦躁及入睡困难等问题。
2、镇惊止痉
该药材可平息肝风内动，对小儿高热惊厥、癫痫发作等急症有辅助治疗作用。
3、解毒疗疮
辰砂外用能抑制局部细菌生长，传统用法是将煅烧后的粉末调制成膏剂，敷于疮痈肿毒或虫蛇咬伤处。其收敛作用有助于缓解皮肤溃烂、湿疹瘙痒等表皮炎症反应。
4、清喉利咽
研磨成极细粉末后吹喉，可改善咽喉肿痛、口舌生疮等上焦热毒症状。需严格控制剂量避免汞中毒，现代临床已较少采用这种给药方式。
5、防腐抑菌
辰砂的汞成分具有较强防腐性能，古代用于保存尸体或药材防蛀。研究发现其体外对金黄色葡萄球菌等病原微生物有抑制作用，但已不推荐作为常规抗菌剂使用。
需注意的是，辰砂所含硫化汞具有神经毒性和肝肾毒性，内服必须经过严格炮制且单次用量不超过0.5克。孕妇、肝肾功能不全者禁用，外用时应避免大面积长期使用。现代药典已将其列为限制使用药材，临床建议优先选择更安全的替代药物。