酪酸梭菌二联活菌散属于益生菌类药物，婴儿服用该药物的时长需遵医嘱。通常情况下，医生会根据婴儿的肠道症状恢复情况调整疗程，家长不可自行延长用药时间。
酪酸梭菌二联活菌散主要用于调节肠道菌群，改善腹泻、消化不良等症状。若婴儿症状较轻，如偶发腹泻或轻微腹胀，可能服用3-5天后症状缓解即可停药。若存在较严重的肠道菌群失调或迁延性腹泻，医生可能建议用药1-2周。早产儿、低体重儿等特殊群体需严格按医嘱调整用药方案。
家长需注意，益生菌制剂不宜长期使用。若婴儿用药3天后症状未改善，或出现呕吐、发热等情况，应立即停药并就医。日常喂养中应注意奶具消毒，避免腹部受凉，母乳喂养的母亲需保持饮食清淡，有助于促进婴儿肠道功能恢复。