液态氮冷冻除疣通常会引起轻度至中度疼痛感，具体痛感因人而异，与治疗部位、个体耐受度等因素有关。多数患者可耐受，但少数人可能出现较明显的不适。
液态氮冷冻治疗时，低温会刺激皮肤神经末梢，导致短暂刺痛或灼热感。疼痛程度受治疗区域影响，例如足底、手指等角质层较厚的部位因冷冻时间较长，可能痛感更明显。儿童或痛阈较低的人群对冷冻治疗的敏感度较高，可能出现较强痛感。治疗结束后，局部可能出现红肿、水疱等反应，伴随持续数小时的隐痛或胀痛，通常可通过冷敷缓解。
进行液态氮冷冻治疗后需保持创面清洁干燥，避免自行挑破水疱。若疼痛持续加重或出现感染迹象，应及时复诊。治疗前可与医生沟通自身疼痛耐受情况，必要时采取局部麻醉措施以减轻不适。