甲硝唑和奥硝唑均属于硝基咪唑类抗菌药物，但二者在抗菌活性、代谢特点、不良反应等方面存在一定差异。甲硝唑主要用于治疗厌氧菌感染及滴虫、阿米巴等原虫感染，而奥硝唑的抗菌谱更广且半衰期更长。
甲硝唑的抗菌作用主要通过干扰病原体DNA合成实现，对脆弱拟杆菌、梭杆菌等厌氧菌有较强杀灭作用，但对需氧菌无效。奥硝唑除保留对厌氧菌的活性外，对部分革兰阳性菌也显示抑菌效果。在药代动力学方面，甲硝唑半衰期约8小时需每日多次给药，奥硝唑半衰期长达14小时可实现每日单次给药。
甲硝唑常见不良反应包括恶心、金属味等消化道症状，且与酒精联用易引发双硫仑样反应。奥硝唑的中枢神经系统反应如头痛、眩晕发生率略高，但胃肠刺激相对较轻。特殊人群用药需注意：甲硝唑在妊娠早期禁用，而奥硝唑在哺乳期需慎用。
这两种药物的选择需根据感染类型、患者基础状况及药物敏感性决定。临床使用时应严格遵循医嘱，避免自行调整用药方案。治疗期间出现严重皮疹、神经毒性等症状应立即停药并及时就医。