扁桃体炎一般可以挂耳鼻喉科、内科或儿科等科室就诊，建议根据患者年龄及具体症状选择合适科室。若伴随高热、吞咽困难等症状，也可前往急诊科处理。
耳鼻喉科是诊治扁桃体炎的主要科室。该科室医生通过咽喉视诊、血常规检查等手段可明确扁桃体充血、肿大程度，判断属于急性还是慢性炎症，并根据感染类型开具抗炎药物或雾化治疗。若反复发作或形成扁桃体周围脓肿，还可提供手术切除建议。
内科或呼吸内科可处理由细菌或病毒感染引起的扁桃体炎。医生会根据咽拭子培养结果选择抗生素或抗病毒药物，如头孢克肟片、阿莫西林胶囊、利巴韦林颗粒等。若伴有咳嗽、咳痰等呼吸道症状，可同步进行止咳化痰治疗。
儿童出现扁桃体炎建议选择儿科就诊。儿科医生会根据儿童生理特点调整药物剂量，采用儿童专用剂型如布洛芬混悬液退热，并提供饮食指导避免刺激性食物加重咽喉疼痛。若扁桃体肥大影响呼吸或出现睡眠呼吸暂停，可能转诊至耳鼻喉科进一步处理。
就诊时可提前准备近期体温记录、用药史等信息以便医生快速判断病情。治疗期间需避免辛辣食物刺激咽喉黏膜，用淡盐水漱口保持口腔卫生。若出现呼吸急促、颈部肿胀等急症表现，应立即前往急诊科就医。