头孢类药物和阿奇霉素属于不同类别的抗生素，两者适用情况不同，无法直接比较优劣。头孢类抗生素对革兰阳性菌和部分革兰阴性菌敏感，而阿奇霉素对支原体、衣原体等非典型病原体效果较好，具体需根据感染类型及药敏结果选择。
头孢类抗生素属于β-内酰胺类药物，通过破坏细菌细胞壁发挥杀菌作用。第三代头孢如头孢曲松、头孢噻肟钠对肺炎链球菌、流感嗜血杆菌等呼吸道感染常见致病菌敏感，常用于细菌性肺炎、尿路感染等。阿奇霉素属于大环内酯类抗生素，通过抑制细菌蛋白质合成起效，对肺炎支原体、衣原体感染等非典型病原体具有优势，适用于社区获得性肺炎、支气管炎等。
细菌的耐药性是选择抗生素的重要依据。例如，针对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染，头孢类药物可能无效；而支原体感染若对大环内酯类耐药，则需改用四环素类或氟喹诺酮类药物。临床用药需结合患者年龄、过敏史、肝肾功能等因素综合判断，建议在医生指导下规范使用抗生素，避免自行选择导致治疗失败或耐药性产生。