C14呼气试验存在微量辐射，但通常不会对人体造成伤害。该检查使用的碳-14同位素会释放β射线，但其辐射剂量极低，约为0.003-0.005毫西弗，远低于人体每年自然接受的辐射量（约2.4毫西弗）。检查后碳-14会通过尿液和呼吸自然排出体外，无需特殊防护。
C14呼气试验的辐射剂量与检查试剂用量相关。常规检测使用的碳-14尿素胶囊剂量通常为0.75-1微居里，这种微量辐射在安全范围内。但孕妇、备孕女性和儿童群体因组织器官更为敏感，建议选择无辐射的C13呼气试验替代。
进行C14呼气试验前应空腹2小时以上，检查后适当增加饮水量可促进同位素排泄。虽然该检查总体安全性较高，但具体实施时应严格遵循医嘱，尤其是特殊人群需在医生指导下选择最适宜的检测方案。