长期自慰一般不会导致阴茎短小。阴茎的发育主要受遗传、激素水平和青春期发育影响，适度自慰属于正常生理行为，通常不会对阴茎长度产生负面影响。
阴茎的大小主要由先天遗传因素决定，青春期阶段睾酮水平对阴茎发育起关键作用。正常生理结构下，阴茎海绵体和尿道海绵体的体积在发育成熟后基本固定，自慰过程中引起的暂时性充血不会改变其解剖结构。过度自慰可能引起疲劳、注意力下降等问题，但不会直接影响阴茎长度。
若自觉阴茎发育异常，建议到正规医院泌尿外科就诊，通过专业测量评估实际发育情况。医生会检查是否存在隐睾、激素分泌异常等可能影响生殖器发育的疾病。日常生活中应正确认识性生理知识，避免因误解产生焦虑情绪。