药物流产一般不会直接导致输卵管堵塞，但存在间接风险。药物流产是通过药物终止妊娠的方式，其操作本身不会损伤输卵管结构，但若出现感染或护理不当等情况，可能增加输卵管炎风险，进而引发堵塞。
药物流产后若发生宫腔感染，致病菌可能经宫颈上行至输卵管，引发输卵管炎。长期未治疗的炎症会导致黏膜粘连、纤毛功能受损，最终形成堵塞。此外，药物流产后若发生妊娠组织残留，需进行清宫手术，此时宫腔操作可能增加感染概率。反复流产（包括药物或手术）也会使感染风险累积，间接影响输卵管健康。
药物流产后需遵医嘱使用抗生素（如头孢克肟颗粒、甲硝唑片、左氧氟沙星片等）预防感染，并注意外阴清洁、避免过早同房。若流产后出现持续腹痛、发热、异常分泌物等症状，需及时就医排查感染。日常应科学避孕，减少非意愿妊娠及流产次数，以降低生殖系统并发症风险。