阴茎发育异常可能与先天性畸形、内分泌疾病、染色体异常等有关，具体病因需结合临床检查判断。若出现相关症状，建议及时就医明确诊断。
1.先天性畸形
尿道下裂、包茎等先天性畸形可能影响阴茎的正常发育。尿道下裂表现为尿道开口位置异常，常伴随阴茎弯曲；包茎则因包皮口狭窄限制阴茎头外露。此类情况通常需通过手术矫正，如尿道成形术、包皮环切术等。
2.内分泌疾病
生长激素缺乏、甲状腺功能减退等内分泌异常会影响激素水平，导致阴茎发育迟缓。例如生长激素不足可能引起小阴茎症，表现为阴茎长度低于同龄标准。治疗上可遵医嘱使用重组人生长激素注射液、左甲状腺素钠片、甲巯咪唑片等药物调节激素水平。
3.染色体异常
克氏综合征（47,XXY）等染色体疾病会导致睾丸发育不良，睾酮分泌不足，进而影响阴茎生长。此类患者可能出现阴茎短小、第二性征不明显等症状，通常需要长期雄激素替代治疗，如十一酸睾酮软胶囊、丙酸睾酮注射液、庚酸睾酮注射液等。
日常需注意观察儿童生殖器发育情况，若发现阴茎形态异常、尺寸明显小于同龄人或伴有排尿困难，应尽早就诊。通过染色体核型分析、激素水平检测、超声检查等手段明确病因后，由医生制定个体化治疗方案。