茵陈与柴胡合用通常具有协同清热利湿、疏肝利胆、退热解表、抗炎保肝以及调和肝脾等增效作用。二者配伍在中医临床中常用于肝胆湿热、肝郁气滞等证型的治疗，可发挥互补效果。
1.协同清热利湿
茵陈擅长清利肝胆湿热，柴胡可疏泄肝胆郁热，二者合用能增强退黄效果。对于湿热蕴结引起的黄疸、小便短赤等症状，可加速湿热之邪排出，如急性肝炎见身目发黄时常用此配伍。
2.疏肝利胆增效
柴胡为疏肝要药，能条达肝气；茵陈促进胆汁分泌，二者协同可改善肝胆气滞。对于胆囊炎、胆石症等肝胆疏泄失常导致的胁痛、口苦等症状，可增强利胆排石功效。
3.退热解表协同
柴胡具有和解退热作用，茵陈能清透湿热，合用时对湿热郁遏所致的发热效果显著。对于外感湿热或肝胆湿热引起的反复低热、午后潮热等症状，退热持续时间更持久。
4.抗炎保肝增效
现代研究表明，茵陈中的绿原酸与柴胡皂苷协同可增强抗炎作用，抑制肝脏炎症反应。二者配伍能降低转氨酶水平，促进肝细胞修复，对酒精性肝病、药物性肝损伤有保护作用。
5.调和肝脾协同
柴胡疏肝解郁，茵陈利湿健脾，合用可改善肝郁克脾证候。对于肝气犯胃导致的脘腹胀闷、食欲不振等消化系统症状，能同步调节肝胆与脾胃功能。
茵陈与柴胡的配伍需根据具体证型调整用量比例，肝胆湿热重者茵陈可增量，肝郁明显者柴胡可加量。使用前应经中医师辨证，避免用于阴虚火旺或脾胃虚寒者。煎煮时茵陈后下可保留挥发性成分，与柴胡共煎30分钟为宜。