幽门螺杆菌感染若不及时治疗，可能引发慢性胃炎、消化性溃疡，甚至增加胃癌等严重疾病的风险。长期感染还可能影响营养吸收或导致其他系统疾病。
幽门螺杆菌在胃内持续繁殖会破坏胃黏膜屏障，刺激胃酸分泌增加。这种持续的炎症反应可能逐渐发展为慢性萎缩性胃炎，胃黏膜腺体逐渐减少，胃功能受损。部分患者可能出现反酸、腹胀等消化道症状反复发作。
感染导致的胃黏膜损伤若持续加重，可能形成胃溃疡或十二指肠溃疡。溃疡病灶可引起规律性上腹痛，严重时可能并发消化道出血或穿孔。数据显示约15-20%未经治疗的感染者会发展为消化性溃疡。
世界卫生组织将幽门螺杆菌列为I类致癌物。长期感染可使胃癌发生风险提高2-6倍，特别是伴有胃黏膜萎缩或肠上皮化生者。感染还可能导致胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤，虽然发生率较低但需警惕。
幽门螺杆菌会影响铁元素吸收，可能导致缺铁性贫血。某些菌株产生的细胞毒素可能通过分子模拟机制引发血小板减少性紫癜等免疫性疾病。孕妇感染可能增加妊娠剧吐风险。
建议确诊感染者及时接受规范的四联疗法治疗，疗程结束后需复查确认根除。日常应注意分餐制避免交叉感染，保持规律饮食，避免过量摄入刺激性食物。40岁以上感染者建议定期胃镜检查监测胃黏膜变化。