长期胃食管反流存在一定的癌变风险，但概率相对较低，多数患者经过积极治疗可有效降低风险。胃食管反流病若长期未控制，可能引发食管黏膜病变，需结合具体病情进行判断。
长期胃食管反流可能引发巴雷特食管，而巴雷特食管属于癌前病变。当胃酸反复刺激食管下段黏膜时，可能造成鳞状上皮被柱状上皮取代，这种情况持续存在可能增加食管腺癌的发生概率。但实际癌变比例较低，多数患者可通过规范治疗控制病情。
癌变风险与反流频率、食管损伤程度密切相关。若患者长期忽视治疗，未使用抑酸药物或调整生活方式，导致食管黏膜长期处于炎症状态，则可能促进异常增生。但及时干预如遵医嘱服用奥美拉唑、雷贝拉唑等药物，并配合饮食管理，可显著改善黏膜修复，减少恶变可能。
建议长期存在胃食管反流症状的患者定期进行胃镜监测，尤其伴随吞咽困难、消瘦等症状时需及时就诊。日常需避免高脂饮食、睡前进食等诱因，严格遵医嘱进行药物或手术治疗，可有效控制病情发展并降低癌变风险。