性生活后阴茎疼痛的持续时间因个体差异和具体原因不同而有所区别。生理性疼痛通常会在1至2天内逐渐缓解，而病理性疼痛可能持续较长时间或反复出现。建议根据疼痛的性质和伴随症状进行初步判断。
生理性原因多与性生活过程中过度摩擦或姿势不当有关，可能导致阴茎表面皮肤或黏膜轻微损伤。这种情况下疼痛多为暂时性，适当休息、清洁护理后，多数可在24至48小时内自行消退。若疼痛持续超过3天且无缓解迹象，需警惕是否存在包皮龟头炎、尿道炎等感染性疾病，此类情况可能因细菌或真菌侵袭引发炎症反应，导致疼痛伴随红肿、分泌物增多等症状。
前列腺炎或精囊炎等泌尿系统炎症性疾病也可能在性生活后因局部充血而加重不适感，疼痛可能持续数日且伴随尿频、尿急等排尿异常。此外，阴茎海绵体损伤或尿道损伤较为少见但后果严重，此类外伤性疼痛常表现为剧烈且持续性，可能伴有淤血、排尿困难等症状。
若疼痛持续时间超过3天或逐渐加重，应及时到泌尿外科就诊。医生可能通过尿常规、分泌物培养或超声检查明确病因，并根据结果选择抗生素、抗炎药等治疗方案。治疗期间需避免再次性生活，保持局部清洁干燥，以促进恢复。