牙结石自然脱落是否会造成损伤需要根据具体情况判断。牙结石脱落过程中可能因体积较大或位置特殊导致局部损伤，但部分情况下也可能无明显影响。
体积较大的牙结石在脱落时可能划伤牙龈组织或导致牙齿表面粗糙。这类牙结石通常附着在龈沟内，其不规则边缘在脱离过程中容易对脆弱的牙龈造成机械性损伤，可能引发局部出血或牙龈撕裂。此外，牙结石脱落后暴露的牙根面可能因长期被结石覆盖而变得敏感，容易受到冷热刺激。
体积较小的牙结石脱落通常风险较低。这类结石多位于牙齿邻面或咬合面沟隙，脱落时因接触面积小，对周围组织产生的摩擦较小。但需注意，即使小颗粒结石脱落，仍可能残留在龈沟内引发炎症反应。
建议发现牙结石应及时到正规口腔医疗机构进行超声波洁治。专业的洁牙操作能有效清除龈上龈下结石，同时通过抛光处理可减少牙齿表面粗糙度。日常应保持每天两次巴氏刷牙法清洁，并配合使用牙线维护牙间隙卫生，避免牙结石再次形成。