自慰一般不会直接影响未来的生育能力，但过度或不当的自慰行为可能间接导致一些健康问题。适度的自慰是正常的生理现象，不会对生殖系统功能造成损害，但需注意卫生和频率。
男性生育能力主要与精子质量相关，而睾丸会持续生成新的精子，适度自慰不会导致精子数量减少或质量下降。但频繁自慰可能引起生殖器充血、局部炎症或前列腺反复充血，若未及时处理可能增加感染风险。女性自慰主要涉及外阴刺激，适度行为不会损伤子宫或卵巢功能，但操作不当可能造成黏膜损伤或诱发尿道感染。
如果自慰后出现生殖器疼痛、排尿异常或分泌物异常等现象，可能与感染相关，需及时就医排除尿道炎、前列腺炎等疾病。长期因自慰产生焦虑、负罪感等心理压力，可能间接影响性功能，这种情况建议通过心理咨询调整心态。日常应注意保持外阴清洁，避免使用异物刺激，控制每周1-2次的适度频率。
对于有生育需求的人群，建议提前进行孕前检查，通过精液分析、激素检测等客观评估生育能力。若存在持续性勃起障碍、射精困难等问题，应及时到泌尿外科或生殖医学科就诊，排查器质性疾病而非归咎于自慰行为本身。