长期手淫通常不会导致阴茎变小。阴茎的形态大小主要由先天遗传和青春期激素水平决定，适度手淫属于正常生理行为，不会对生殖器发育产生负面影响。但若存在过度手淫或伴随其他异常症状时，需注意排查其他潜在问题。
从生理结构来看，阴茎主要由海绵体和结缔组织构成，其大小在青春期后基本定型。手淫时阴茎的充血勃起属于暂时性生理变化，不会造成组织萎缩或结构改变。部分人群可能因频繁手淫产生疲劳感，但这种状态在充分休息后可自行恢复。
如果自觉阴茎外观改变，需考虑其他病理因素，如内分泌疾病导致的第二性征发育异常，或是佩罗尼氏病等阴茎畸形病变。此外，长期焦虑等心理因素可能引发躯体化症状，造成主观上的尺寸认知偏差。
保持适度频率的手淫并不会影响身体健康，建议避免过度关注生殖器尺寸。若伴有疼痛、勃起功能障碍或明显的外观异常，应及时到泌尿外科就诊，通过激素检测、超声检查等手段明确病因。日常应注意保持规律作息，避免穿过紧的内裤影响局部血液循环。