阴茎异常分泌物的鉴别诊断通常需要结合体格检查、实验室检查以及影像学检查等方法综合分析，具体需根据患者个体情况由医生判断。
1、体格检查
医生首先会观察分泌物的颜色、性状及量，例如黄色脓性分泌物可能提示淋球菌感染，白色稀薄分泌物可能与支原体、衣原体感染有关。同时检查阴茎、尿道口有无红肿、溃疡等体征，触诊是否存在附睾、前列腺压痛，初步判断感染部位及性质。尿道触诊时有脓液溢出常提示尿道炎可能。
2、实验室检查
取尿道分泌物进行革兰氏染色涂片，发现白细胞内革兰阴性双球菌可初步诊断淋病。进行细菌培养及药敏试验能明确病原体类型，如培养出解脲支原体可确诊非淋菌性尿道炎。核酸检测如PCR技术对衣原体、支原体等病原体具有高敏感性和特异性。血液检查包括HIV、梅毒血清学检测，用于排除性传播疾病。
3、影像学检查
对于反复发作或治疗效果不佳的患者，可能需要进行超声检查明确是否存在前列腺炎、精囊炎等并发症。怀疑尿道狭窄时可选择尿道造影，通过造影剂显影观察尿道结构异常。CT或MRI主要用于排查泌尿系统结核、肿瘤等少见病因，特别是伴有血性分泌物时需重点排除。
出现阴茎异常分泌物应及时到泌尿外科或皮肤性病科就诊，避免自行使用抗生素导致耐药。治疗期间应禁止性生活，性伴侣需同时接受检查治疗。保持外阴清洁干燥，避免穿过紧内裤，忌食辛辣刺激食物有助于恢复。