阴茎夜间疼痛可能是生理性原因所致，也可能与前列腺炎、尿道炎、阴茎硬结症等疾病原因有关，建议及时就诊查明病因。
1、生理性原因
阴茎夜间疼痛可能与局部受压、过度摩擦等生理因素有关。例如夜间睡眠姿势不当导致阴茎长时间受压，或性生活过于频繁造成局部组织劳损，可能引发短暂性疼痛。此类疼痛通常在休息、调整姿势或减少活动后逐渐缓解，一般无需特殊治疗。
2、前列腺炎
细菌感染或前列腺长期充血可能引发炎症，当前列腺肿胀时会压迫周围神经，夜间平卧时盆腔充血加重，可能导致阴茎放射性疼痛。患者常伴有尿频、尿急、会阴部坠胀感等症状。一般可以遵医嘱使用左氧氟沙星片、盐酸坦索罗辛缓释胶囊、塞来昔布胶囊等药物进行抗感染和缓解疼痛治疗。
3、尿道炎
淋球菌或衣原体等病原体感染尿道黏膜时，炎症刺激可能引起阴茎灼痛，夜间尿液浓缩可能加剧症状。典型表现包括排尿刺痛、尿道口红肿及异常分泌物。通常需在医生指导下使用头孢克肟分散片、阿奇霉素肠溶片、热淋清颗粒等药物进行抗感染治疗。
4、阴茎硬结症
阴茎白膜纤维斑块形成可能导致勃起时弯曲疼痛，夜间阴茎勃起可能诱发或加重不适。疾病进展期可能出现触摸硬结、勃起障碍等表现。治疗时可使用维生素E软胶囊、秋水仙碱片改善纤维化，严重者需考虑阴茎斑块切除等手术方式。
如果排除生理性原因后疼痛持续存在或伴随其他异常症状，应及时到泌尿外科就诊。通过前列腺液检查、超声检查或尿道分泌物培养等明确诊断后，需严格遵循医嘱进行规范治疗，避免自行用药延误病情。