氯酸钾有毒。作为强氧化剂，氯酸钾可通过口服、吸入或皮肤接触等途径引起中毒，严重时可能危及生命。其毒性主要来源于化学性质活跃的氯酸根离子，进入人体后会干扰细胞正常代谢。
氯酸钾对皮肤、黏膜具有强刺激性，接触后可能引发红肿、灼痛甚至溃烂。若误食或吸入，高浓度的氯酸钾会迅速腐蚀消化道和呼吸道黏膜，导致呕吐物带血、呼吸困难等症状。其强氧化性可使血红蛋白失去携氧能力，造成全身组织缺氧，表现为口唇发绀、意识模糊等。长期接触还可能损害肝肾功能，引起黄疸、尿量减少等器官功能异常。
发现氯酸钾中毒时应立即脱离接触环境，沾染皮肤需用流动清水冲洗至少15分钟。误服者禁止催吐，应及时携带剩余物就医。医护人员会根据中毒途径采取洗胃、吸氧、血液净化等急救措施，并使用亚甲蓝等药物纠正高铁血红蛋白血症。日常接触该化学品时应佩戴防护装备，严格遵循安全操作规程，避免在非通风环境中使用。