眨眼时疼痛可能与结膜炎有关，但也可能由其他眼部问题引起，需结合具体症状综合判断。结膜炎是常见病因之一，但单凭眨眼疼痛无法直接确诊。
结膜炎患者除眨眼疼痛外，常伴有结膜充血、分泌物增多等症状，多由细菌或病毒感染引发。若疼痛伴随干涩、异物感，可能为干眼症导致泪膜不稳定对角膜产生的刺激。角膜炎引起的疼痛通常更为剧烈，且常伴随视力模糊、畏光等表现。眼睑炎患者还可能观察到眼睑红肿或麦粒肿形成。
建议出现持续性眨眼疼痛时，避免揉搓眼睛或自行使用眼药水。可通过冷敷暂时缓解不适，但需注意保持敷料清洁。日常需注意手部卫生，避免佩戴隐形眼镜直至症状消退。若疼痛持续超过24小时或出现视力变化，应及时到眼科进行裂隙灯检查、泪液分泌试验等专业评估，以便针对病因进行治疗。