寻常疣复发率高的原因主要与人乳头瘤病毒清除不彻底、机体免疫力较低以及不良生活习惯等因素有关。该疾病由HPV感染引起，治疗后可能因病毒残留导致反复发作。
1、病毒未完全清除
HPV具有潜伏感染特性，部分病毒可能隐藏于表皮基底层或皮肤附属器中。当常规治疗仅去除表面疣体时，深层病毒在免疫力下降时会再次活跃，形成新的皮损。临床上常采用液氮冷冻治疗联合重组人干扰素α2b凝胶进行综合治疗。
2、免疫功能低下
患有艾滋病、器官移植术后或长期使用免疫抑制剂者，其T淋巴细胞功能受损，无法有效识别和清除HPV病毒。这类患者复发率可达普通人群的3-5倍，需配合胸腺肽肠溶片、转移因子胶囊等免疫调节药物进行治疗。
3、不良生活习惯
共用剃须刀、搓澡巾等物品会造成病毒再次接种。研究显示约23%复发患者存在家庭成员交叉感染史。反复机械摩擦患处皮肤也会促进病毒扩散，常见于手足多汗症患者。
出现反复发作情况时，建议进行HPV分型检测和免疫功能评估。治疗期间应避免搔抓皮损，保持患处干燥清洁，家庭成员需实行个人物品分用制度，必要时可接种HPV疫苗增强防护。