咽炎雾化治疗可能会产生副作用，但多数情况下副作用较轻微且可控。常见不良反应包括口干、咽喉刺激感等，少数患者可能出现过敏反应或继发感染，需及时就医处理。
雾化治疗通过将药物分散成微小颗粒直接作用于咽喉黏膜，起效较快。但部分药物成分可能对局部组织产生刺激，例如激素类药物可能引起口腔干燥、声音嘶哑，支气管扩张剂可能导致心悸或震颤。此外，若雾化装置消毒不彻底，可能增加口腔真菌感染风险。过敏体质患者使用抗生素类雾化药物时，可能出现皮疹、气道痉挛等过敏反应。
进行雾化治疗后建议立即用清水漱口，减少药物在口腔残留。治疗过程中若出现持续咳嗽加重、呼吸困难或皮肤瘙痒等症状，应立即停止雾化并告知医生。雾化器应专人专用并定期消毒，药物选择需严格遵循医嘱，不可自行调整用药方案。