生殖器疱疹可能会引发其他并发症，但具体情况因人而异。多数患者在及时治疗和规范护理下可有效控制病情，但免疫力低下或未及时干预时可能出现并发症。
生殖器疱疹由单纯疱疹病毒引起，病毒可潜伏在神经节内反复激活。若局部皮损因搔抓继发细菌感染，可能引发蜂窝织炎或化脓性溃疡。妊娠期感染可能通过垂直传播导致胎儿宫内感染，增加流产、早产风险。新生儿经产道感染可能发生疱疹性角膜炎或播散性疱疹，死亡率可达60%。免疫缺陷病患者可能出现直肠炎、脑膜炎等严重并发症。
建议出现水疱、溃疡等典型症状时及时就诊，遵医嘱使用阿昔洛韦乳膏、泛昔洛韦片等抗病毒药物。保持患处清洁干燥，避免性接触防止传染。复发频繁者可进行病毒抑制治疗，定期复查评估免疫功能。配偶或性伴侣应同时接受检测，育龄女性孕前需进行优生筛查。