马齿苋长期服用是否会有副作用需根据具体情况判断。合理使用且体质适宜的情况下通常较安全，但长期或过量可能引发不良反应。
马齿苋作为中药材，其性味寒凉，具有清热解毒的功效。若遵医嘱短期使用，通常不会产生明显副作用。但若长期大量服用，可能刺激胃肠道，导致腹痛、腹泻等症状，尤其脾胃虚寒者更易出现此类反应。此外，马齿苋含草酸等成分，过量摄入可能增加泌尿系统结石风险。
特殊人群需特别注意。孕妇长期服用可能影响子宫平滑肌，存在流产风险；肾功能不全者长期使用可能加重代谢负担。部分人群可能出现过敏反应，如皮肤瘙痒、红肿等，与个体体质差异相关。
建议在中医师指导下规范使用马齿苋，连续服用不宜超过2周。出现不适症状应立即停用并就医，用药期间避免同时食用寒凉食物。体质偏寒或存在慢性疾病者，使用前需经专业医师评估。