马齿苋可能具有一定的辅助抑菌作用，但无法直接替代药物治疗细菌感染。其抗菌效果目前主要基于实验室研究，实际应用需谨慎评估。
马齿苋中含有生物碱、黄酮类化合物等成分，体外实验显示这些物质对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等常见致病菌有抑制作用。动物实验表明其提取物能降低局部感染程度，但相关研究尚未在人体临床试验中得到充分验证。在传统医学中，马齿苋多用于湿热泻痢的辅助治疗，常与黄连、黄芩等药材配伍使用。
若发生明确细菌感染，应及时就医进行病原学检查。临床治疗通常需根据药敏试验结果选择抗生素，如头孢克肟片、阿莫西林胶囊、左氧氟沙星片等规范用药。日常饮食中适量食用马齿苋可作为辅助手段，但出现发热、化脓等感染症状时，应避免自行用药延误治疗。