连花清瘟胶囊与抗生素一般可以联合使用，但需在医生指导下进行。两者的作用机制不同，联用通常不会产生直接冲突，但具体用药方案需根据病情判断。
连花清瘟胶囊属于中成药，具有清瘟解毒、宣肺泄热的功效，常用于治疗流行性感冒属热毒袭肺证。抗生素主要用于细菌感染的治疗，如头孢克肟、阿莫西林、左氧氟沙星等。若患者同时存在流感继发细菌感染的情况，医生可能根据感染类型选择适宜的抗生素与连花清瘟联用，但需注意两者服药时间需间隔1小时以上，避免相互作用影响药效。
使用过程中可能出现胃肠道不适等不良反应，建议分别观察药物反应。肝肾功能异常者、孕妇等特殊人群需严格遵医嘱调整剂量。若联用后出现皮疹、呼吸困难等过敏症状，应立即停药并就诊。