芥菜作为药食同源的植物，其药用价值主要体现在散寒解表、消肿止痛、促进消化、抗菌消炎以及祛痰止咳等方面。传统中医和现代研究均对其药用特性有所记载，但需在医生指导下合理应用。
1、散寒解表
芥菜性温味辛，中医认为其辛散特性有助于驱散体表寒邪，对于风寒感冒初期出现的恶寒、鼻塞等症状可能起到辅助缓解作用。其含有的挥发性物质可能通过刺激体表血液循环发挥作用。
2、消肿止痛
芥子中的硫代葡萄糖苷分解后生成的异硫氰酸酯类物质，具有促进局部血液循环的作用。外用时可通过制成膏贴敷于关节肿痛部位，但需注意可能引发皮肤刺激反应。
3、促进消化
芥菜含有3.5-4.5g/100g的膳食纤维，能促进肠道蠕动。其特有的辛辣成分芥子油可刺激消化液分泌，有助于改善功能性消化不良引起的食欲减退症状。
4、抗菌消炎
体外实验显示芥菜提取物对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等常见致病菌有抑制作用，这与其中含有的硫苷类化合物及其分解产物有关，但实际临床应用仍需进一步研究验证。
5、祛痰止咳
芥菜种子在中医炮制后制成的芥子泥，通过外敷肺俞穴可产生温热刺激，促进呼吸道分泌物排出。其含有的丙烯酸酯类物质可能通过刺激黏膜反射促进排痰。
食用芥菜建议每日摄入量控制在100-150克，溃疡病患者及过敏体质者慎用。药用时应遵循传统炮制规范，避免直接大量食用未经处理的芥子。出现相关症状建议及时就医，在医生指导下合理使用药物进行规范治疗。