甲状腺炎发作时通常可以挂内分泌科、普通外科、风湿免疫科、核医学科或急诊科就诊，具体需结合病情特点选择。该疾病可能涉及多个系统的异常，必要时需多学科联合诊疗。
1、内分泌科
甲状腺炎多属于内分泌系统疾病，尤其是桥本甲状腺炎、亚急性甲状腺炎等类型。内分泌科医生可通过甲状腺功能检查、抗体检测等手段评估激素水平异常，并指导左甲状腺素钠片、甲巯咪唑片等药物治疗。
2、普通外科
当出现甲状腺明显肿大压迫气管、疑似合并恶性肿瘤或形成脓肿时，需外科评估手术指征。医生会根据超声检查、细针穿刺活检等结果，决定是否进行甲状腺部分切除术等治疗。
3、风湿免疫科
若甲状腺炎继发于系统性红斑狼疮、干燥综合征等自身免疫性疾病，或伴有抗甲状腺过氧化物酶抗体显著升高时，风湿免疫科可进行免疫抑制剂治疗，常用药物包括醋酸泼尼松片、硫唑嘌呤片等。
4、核医学科
放射性碘摄取率检查对亚急性甲状腺炎具有诊断价值，核医学科可协助开展此项检查。对于合并甲状腺功能亢进症的病例，医生会评估是否适合放射性碘治疗。
5、急诊科
突发高热伴甲状腺区剧烈疼痛、出现呼吸困难或意识障碍等危急情况时，应立即急诊就诊处理，医生会优先进行生命支持治疗。
建议首次就诊可选择内分泌科，接诊医生会根据甲状腺触诊、血液检查结果进行初步分型。若检查提示存在手术指征或合并其他系统病变，应及时转诊至相应专科。日常应注意观察颈部肿胀程度、体温变化等情况，避免延误急性期的诊治时机。