黄连的副作用主要包括胃肠道不适、过敏反应、低血糖等，长期或过量使用可能引发不良反应，需遵医嘱用药。
1、胃肠道不适
黄连中的小檗碱等成分可能刺激胃黏膜，部分人群服用后会出现恶心、呕吐、腹胀或腹泻等症状。空腹服用或剂量过大时，胃肠道刺激可能加重。
2、过敏反应
少数患者可能对黄连中的生物碱成分产生过敏，表现为皮肤瘙痒、红疹或荨麻疹。极个别严重过敏者可能出现呼吸困难、喉头水肿等过敏性休克症状，需立即就医。
3、低血糖风险
黄连具有一定降血糖作用，糖尿病患者若与其他降糖药物联合使用，可能引发头晕、冷汗等低血糖反应。长期服用需定期监测血糖水平，避免血糖过度降低。
此外，长期大量使用可能抑制肠道正常菌群，导致肠道菌群失调症，出现便秘或腹泻交替等消化功能紊乱。建议严格按医生指导的剂量和疗程使用，脾胃虚寒者及孕妇慎用。若用药期间出现不良反应，应立即停药并就诊。