摄入过量黄瓜可能会导致腹泻，通常与其中的膳食纤维刺激或污染物有关。适量食用一般不会引起明显不适，但需注意食用卫生。
黄瓜含有较多水分和膳食纤维，尤其是果皮中的粗纤维含量较高。短时间内大量食用可能增加肠道蠕动频率，部分人群肠道敏感度较高，过量摄入可能引发渗透性腹泻。此外，膳食纤维在肠道内吸收水分膨胀，可能刺激肠壁神经反射，促使排便次数异常增多。
若黄瓜表面残留农药或微生物污染，过量食用后致病菌可能破坏肠道菌群平衡。大肠杆菌、沙门氏菌等微生物在繁殖过程中产生的代谢产物会刺激肠黏膜，导致炎性渗出增加，引发感染性腹泻，常伴有腹部绞痛、发热等症状。
日常建议将黄瓜每日摄入量控制在300克以内，相当于1-2根中等大小的黄瓜。食用前应使用流动清水冲洗表面，必要时用软毛刷轻刷表皮沟壑处。脾胃虚寒者可将黄瓜适当加热后食用，以降低对消化道的刺激。