海棠果与苹果的食用方法大致相同，但在具体应用上存在一定差异。两者均可通过清洗、削皮或直接食用等方式处理，但海棠果因口感酸涩，通常需加工后食用。
海棠果和苹果的果肉均可生食，但苹果甜度较高，适合直接吃或制作沙拉。海棠果酸味明显，常需用盐水浸泡或糖渍去除涩味，或煮熟后用于制作果酱、蜜饯。两者果核均含微量氰苷类物质，大量咀嚼可能引起不适，因此食用前建议去除内核。烹饪方面，苹果多用于烘焙、炖汤，而海棠果因质地较硬，更适合长时间熬煮以软化纤维。
需注意，海棠果酸性较强，胃酸过多者应控制摄入量。若直接食用时感觉酸涩难忍，可尝试糖水浸泡或与其他甜味水果搭配。日常储存时，两者均需避免高温潮湿环境，成熟海棠果易腐坏，建议尽快加工食用。