椰子油的抗菌作用具有一定科学依据，主要与其成分中的月桂酸等中链脂肪酸相关。多项体外实验和动物研究表明，其可能通过破坏微生物细胞膜结构发挥抗菌效果。
椰子油中的月桂酸含量约占总脂肪酸的50%，这种成分在体内可转化为单月桂酸甘油酯。该物质能穿透细菌细胞膜磷脂双层结构，导致细胞内容物泄漏，从而抑制金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌等革兰阳性菌的生长。部分实验显示，15%浓度的椰子油溶液可使上述细菌存活率下降60%-80%。对于白假丝酵母菌等真菌，椰子油中的癸酸和辛酸能干扰菌丝形成，在体外抑菌实验中表现出剂量依赖性抑制效应。
在口腔应用方面，含椰子油漱口可降低变异链球菌数量约30%，可能与减少牙菌斑生物膜形成有关。但需注意现有研究多为小样本试验，抗菌效果存在个体差异。日常使用时应避免替代正规药物治疗，皮肤局部涂抹可能引发毛孔堵塞风险。建议在专业医师指导下作为辅助抗菌手段使用。