通常需根据具体使用场景和浓度进行判断。两者均为常用消毒剂，但作用机制和适用条件存在差异，联合使用可能产生协同或拮抗效果。
乙醇主要通过使病原体蛋白质变性达到杀菌效果，适用于皮肤表面快速消毒。氯己定通过破坏细胞膜结构并抑制酶活性发挥长效抑菌作用，常用于术前皮肤准备或伤口护理。部分研究显示，低浓度氯己定（如0.5%）与70%乙醇联合使用时，可延长消毒剂在皮肤表面的残留时间，增强对革兰阳性菌的杀灭效果。但需注意高浓度乙醇可能破坏氯己定的阳离子特性，降低其杀菌效力。
实际应用中，医疗机构多根据消毒对象选择单一制剂。外科手消毒多采用乙醇基速干手消毒剂，而术前皮肤准备更倾向使用氯己定-醇复合制剂。日常使用中不建议自行混合两种成分，可能因配比不当导致消毒效果下降。选择消毒剂时应参照说明书指引，针对不同消毒需求选择已通过有效性验证的合规产品。