真菌性毛囊炎的治疗通常以抗真菌药物为主，常用药物包括唑类、丙烯胺类等外用制剂，必要时可联合口服抗真菌药。需根据具体病情在医生指导下选择合适方案，避免自行用药。
1、唑类抗真菌药
唑类药物通过抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成发挥抗菌作用，对马拉色菌等致病真菌有较好效果。患者可遵医嘱使用酮康唑乳膏、联苯苄唑溶液、硝酸咪康唑软膏等外用制剂，使用时需清洁患处后均匀涂抹，保持皮肤干燥。
2、丙烯胺类抗真菌药
此类药物通过干扰真菌细胞膜固醇的生物合成抑制真菌生长，常用特比萘芬喷雾剂、布替萘芬乳膏等。对于范围较大的皮损，可选用溶液剂型更便于大面积喷洒，但需注意可能出现局部刺激反应。
3、其他外用药物
二硫化硒洗剂、复方硫黄乳膏等兼具抗真菌和抑制油脂分泌的作用，适用于头皮等皮脂分泌旺盛部位。每周2-3次洗剂局部清洗，可减少真菌滋生的环境，但需注意避免接触眼睛。
4、口服抗真菌药
对于顽固性、反复发作或累及深部毛囊的感染，可能需联合口服伊曲康唑胶囊、氟康唑片等系统性用药。用药期间需定期监测肝功能，妊娠期及肝功能异常者禁用。
治疗期间需保持患处清洁干燥，避免搔抓导致继发感染。建议穿着透气棉质衣物，定期消毒个人用品。若用药2周后症状无改善或加重，应及时复诊调整治疗方案，不建议自行延长用药时间或更换药物。同时需排查糖尿病等潜在诱发因素，从根源减少复发风险。