褪黑素与咖啡因可能存在一定的相互作用，一般不建议同时使用，具体需根据摄入时间和个体差异综合判断。两者同时摄入可能影响睡眠质量或药物效果，需谨慎调整服用方式。
咖啡因具有中枢神经兴奋作用，可能拮抗褪黑素的助眠效果。咖啡因通过阻断腺苷受体使人保持清醒，而褪黑素通过调节昼夜节律促进睡眠，两者同时摄入可能导致睡眠周期紊乱。特别是睡前4小时内饮用咖啡、浓茶等含咖啡因的饮品，可能减弱褪黑素改善失眠的效果。对于咖啡因代谢较慢的人群，这种影响可能持续更久。
建议两者使用时间至少间隔4-6小时。例如早晨饮用咖啡后，晚间服用褪黑素可降低干扰风险。若存在长期失眠问题，应避免依赖褪黑素，及时到睡眠医学科或神经内科就诊，完善多导睡眠监测等检查。日常需保持规律作息，睡前减少电子设备使用，创造黑暗安静的睡眠环境。