普洱茶的抗氧化能力与绿茶相比各有特点，不能简单判断哪种更强。绿茶由于未经发酵，保留了较多的茶多酚、儿茶素等天然抗氧化成分，其中表没食子儿茶素没食子酸酯（EGCG）具有较强的自由基清除能力。普洱茶经过微生物发酵后，虽然部分儿茶素被分解，但会形成茶褐素、茶红素等次级代谢产物，这些物质同样具有抗氧化活性，且分子结构更易被人体吸收。
研究表明，普洱熟茶中的茶多糖和发酵产生的微生物代谢产物对超氧阴离子和羟自由基的抑制率可达60%-80%。绿茶提取物在体外实验中通常显示更高的总酚含量，但动物实验发现普洱茶在调节血脂、保护肝脏方面的抗氧化效果更显著。两种茶类的抗氧化作用途径不同，绿茶偏向直接清除自由基，普洱茶则更多通过调节体内抗氧化酶系统发挥作用。
日常饮茶时，建议根据个人体质和需求选择。胃肠敏感者更适合性质温和的普洱茶，而追求高含量茶多酚补充可选绿茶。无论选择哪种茶，均需注意避免空腹饮用，控制每日饮用量在5-15克之间，冲泡时第一泡建议快速倒掉以去除杂质。