疟疾复发可能是治疗不彻底、再次感染、免疫力低下以及疟原虫休眠体激活等因素所致。这些诱因可能导致体内残留的疟原虫重新活跃或再次侵入，引起症状反复。
1、治疗不彻底
若未按规范完成抗疟治疗疗程，或药物剂量不足，可能导致疟原虫未被完全清除。例如未全程服用青蒿素类药物、氯喹等，残存的疟原虫在血液中继续增殖，数周后可能再次引发发热、寒战等症状。
2、再次感染
在疟疾流行地区未做好防蚊措施，如未使用蚊帐、驱蚊剂等，可能被携带疟原虫的按蚊再次叮咬。新感染的疟原虫进入人体红细胞后大量繁殖，通常会在7-30天内出现与首次感染相似的周期性发热表现。
3、免疫力低下
患有艾滋病、长期使用免疫抑制剂或营养不良的人群，体内免疫系统无法有效抑制残留的疟原虫。此时即便经过治疗，残存的少量病原体也可能突破免疫防线，导致复发率较健康人群增加3-5倍。
4、疟原虫休眠体激活
间日疟和卵形疟原虫可在肝脏内形成休眠体（hypnozoite），在初次感染数月甚至数年后重新进入血液循环。这类复发具有季节特性，常与人体应激状态、妊娠等因素相关，约占疟疾复发病例的60%以上。
疟疾复发时可能出现典型的三联征（发冷、发热、出汗），建议及时进行血涂片镜检和快速诊断试剂检测。确诊后需根据疟原虫类型选择对应治疗方案，间日疟患者需联合使用杀灭休眠体的伯氨喹。日常应注意防蚊灭蚊，在高发地区居住时可采取预防性服药措施。