牛奶煮沸后部分营养成分可能会有所降低，但具体影响与加热时间和方式有关。一般情况下，短时间煮沸对整体营养价值的影响较小，但某些热敏感的营养素会流失。
牛奶中含有的维生素B1、维生素B2等水溶性维生素对高温较为敏感，长时间煮沸可能导致这些成分部分分解。此外，牛奶中的乳清蛋白在高温下会发生变性，但这种变性不影响其蛋白质的营养价值，反而可能更易被人体消化吸收。牛奶中的钙质在加热过程中通常较为稳定，不会因高温而流失。
日常饮用牛奶时，若需加热，建议采用隔水加热或微波炉短时加热的方式，避免长时间煮沸。对于需要高温灭菌的鲜牛奶，工业化生产采用的超高温瞬时灭菌技术能在杀灭微生物的同时最大限度保留营养。婴幼儿配方奶粉冲泡时应按说明书控制水温，避免过度加热影响营养配比的科学性。