红曲制品一般不适合孕妇、肝肾功能不全者、过敏体质者以及正在服用特定药物的人群长期服用。由于红曲可能含有天然他汀类物质，其使用需结合个人健康状况综合判断。
孕妇应避免长期服用红曲制品。红曲中的活性成分可能通过胎盘影响胎儿发育，特别是在妊娠早期器官形成阶段，存在潜在致畸风险。哺乳期妇女也需谨慎，避免通过乳汁影响婴儿健康。
肝肾功能不全者代谢能力较弱。红曲中的莫纳可林类物质需要经过肝肾代谢，肝酶异常或肌酐清除率下降的患者易出现药物蓄积，可能引发横纹肌溶解或加重肝肾负担，这类人群需定期监测转氨酶和肌酸激酶指标。
正在服用降脂药物者需特别注意相互作用。若同时使用阿托伐他汀、辛伐他汀等HMG-CoA还原酶抑制剂，可能增强药效导致肌肉毒性风险倍增。抗凝药物如华法林钠与红曲联用可能延长凝血酶原时间，增加出血概率。
服用红曲制品期间如出现肌肉酸痛、尿液变色等异常反应，应立即停用并就诊。建议长期使用前进行药物基因检测，特别是SLCO1B1基因多态性检测，评估他汀类药物代谢能力，在医生指导下调整用量。