梅毒潜伏期的误诊几率通常较低，但需结合检测时机、方法及个体情况综合判断。规范检测流程下，多数情况可以准确诊断，但存在一定窗口期或特殊因素可能影响结果准确性。
梅毒潜伏期分为早期和晚期，早期潜伏期通常指感染后一年内，此时虽无临床症状，但血清学检测多为阳性。若在感染后2-4周的窗口期内进行检测，可能出现假阴性结果，导致漏诊。此外，使用非特异性检测方法（如快速血浆反应素试验）时，可能因自身免疫疾病、妊娠或其他感染出现假阳性。合并HIV感染等免疫异常情况，也可能干扰抗体产生规律，影响检测准确性。
建议在高危性行为后4周、12周分别进行梅毒螺旋体颗粒凝集试验等特异性检测，若结果存疑可联合多种方法复查。日常应避免不安全性行为，出现可疑症状或检测结果异常时，及时在皮肤科医生指导下完善相关检查并规范治疗。